台北地检署于12月26日（星期四）以多项罪名正式起诉民众党主席柯文哲，包括贪污图利、违背职务收贿、公益侵占以及背信等罪名，检察官向法院请求对其判处总计28年6个月的徒刑，并处以5000万元新台币（约合207万新元）的罚金。
柯文哲因涉嫌京华城容积率案及政治献金案，已被羁押113天。经过近7个月的调查，检方认定柯文哲在多个案件中存在严重违法行为。其中，针对违背职务收贿的指控，检方求刑15年；涉及侵占民众党政治献金的罪名，求刑5年；通过木可公司侵占政治献金相关行为，求刑6年；此外，利用众望基金会背信行为，求刑2年6个月。
根据检方调查，柯文哲被指控通过一系列行为为财团谋取不当利益，共计造成超过121亿元的损失，同时涉嫌收受上千万元的贿赂，并侵占民众党政治献金数千万元。检方还发现，柯文哲在办公场所被搜查时，曾撕毁便条纸，纸上内容涉及指示共犯出境及检查木可公司内部账目等信息，显示其试图掩饰事实且态度不端正。
在京华城改建案中，检方指出，威京集团主席沈庆京为使项目获得超过560%的容积楼地板面积，通过旗下鼎越开发公司前董事长朱亚虎及京华城监察人张志澄，安排7名人头各捐款30万元，名义上是对民众党的政治献金，实则为向柯文哲行贿共计210万元。朱亚虎随后通过短信通知民众党相关人员款项已交付，而民众党前财务长李文宗收到信息后，转达了柯文哲的谢意。
检方进一步披露，尽管柯文哲明知京华城公司申请高达20%的容积奖励违反相关都市更新法规，仍积极协助鼎越公司获得该项目最高20%的建造许可。案件达成后，柯文哲还亲自收受沈庆京交付的1500万元现金作为贿款。
在政治献金方面，检方指控柯文哲及其相关人员通过肖像权授权金、支付木可公司员工薪资及投资营利事业等方式，挪用政治献金1724万余元。此外，柯文哲通过木可公司侵占政治献金高达4510万余元，并动用众望基金会资金支付竞选办公室员工薪资。
除了柯文哲外，检方还对威京集团主席沈庆京、柯文哲前办公室主任李文宗、前台北副市长彭振声、国民党籍台北市议员应晓薇及其助理吴顺民、台北市前都发局长黄景茂、北市府都发局都委会执行秘书邵琇珮、京华城监察人张志澄等9人提起公诉。
另外，威京集团旗下鼎越开发公司前董事长朱亚虎及威京集团法务经理陈俊源两人获得缓起诉两年处分；而京华城董事长陈玉坤、应晓薇男友王尊侃及应晓薇助理陈佳敏3人因证据不足未被起诉。
12月26日上午，仍在羁押中的柯文哲、沈庆京、应晓薇、李文宗及彭振声被囚车押解至台北地检署，预计当日下午将移送台北地方法院进行后续审理。