乌干达卫生部长巴里奥蒙西星期天（10月25日）宣布，近期曾前往刚果（金）的乌干达公民返国后须隔离21天。乌干达也将加强机场和边境筛查，所有经航空、陆路或水路入境的旅客都须填写追踪表格。
乌干达今年7月宣布最近一轮伊波拉疫情结束。近期，肯尼亚和尼日利亚先后发现确诊病例，两名患者此前都曾途经乌干达，引发卫生专家关注。肯尼亚首名患者从刚果（金）经乌干达转机，10月3日从恩德培国际机场飞往内罗毕，两天后死亡；尼日利亚患者是瑞士一名外交官的妻子，上个月曾到访乌干达。
瑞士当局称，尼日利亚患者在乌干达感染病毒。巴里奥蒙西反驳说，瑞士过早下结论，感染来源应以科学证据判断。他说，患者在乌干达期间曾接触来自西尼罗地区的亲属，而这些亲属此前到过刚果（金）。乌干达卫生部常务秘书阿特维内说，两名患者10月3日曾使用同一机场，但监控录像显示双方没有直接接触。
尼日利亚的病毒基因分析显示，当地病例与肯尼亚首例病例的病毒株高度相近，但尚无证据证明两者存在直接联系。乌干达正与尼日利亚及国际伙伴调查患者旅行史、接触记录和病毒基因序列。巴里奥蒙西说，与肯尼亚病例相关的60名接触者已完成21天健康监测，全部解除观察。