据台湾媒体《联合报》和《中国时报》的报道，国民党主席朱立伦于3月14日（星期五）公开表示，国民党始终支持完善军事审判制度，但对于总统赖清德提出的修法动机表示强烈反对。赖清德此前在3月13日召开国安高层会议，宣布将全面检讨并修订《军事审判法》，以恢复军事审判制度，理由是防范中国大陆对台军的渗透及间谍活动。
朱立伦指出，国民党立委徐巧芯、陈永康及翁晓玲早在2024年就曾提出修订《军事审判法》的主张，目的是为了确保军事审判制度能够适应战时特殊需求。然而，他批评赖清德将修法原因归于台军被大陆渗透的说法，等于是对台军进行污名化，试图“对内寻找敌人”，以此逃避历史责任。朱立伦强调，军事审判制度的破绽源于民进党过去的政治操作，包括前总统蔡英文提出军事裁判权应回归司法院，以及民进党立法院党团总召柯建铭称军事司法审判违宪的言论，这些都导致了当前军事审判的困境。
朱立伦进一步呼吁，如果民进党以大陆渗透台军为由推动修法，赖清德应正视民进党过去政治操作所造成的历史问题，并向受到不公正指责的台军道歉。同时，国民党立院党团于3月14日上午召开会议，决定通过公投提案进行反制。公投主文拟定为：“赖清德总统定位对岸为境外敌对势力，两岸进入准战争状态，你是否同意效法乌克兰实施军事戒严，恢复军事审判？是否有当？敬请全民公决。”据透露，此公投案将与反废死公投案一同于下周提出。